Výbory jsou iniciativní a kontrolní orgány zřízené zastupitelstvem Plzeňského kraje. Výbory plní úkoly, kterými je pověří zastupitelstvo. Svá stanoviska a návrhy předkládají výbory zastupitelstvu. Zastupitelstvo Plzeňského kraje zřizuje vždy výbor finanční, výbor kontrolní a výbor pro výchovu, vzdělávání a zaměstnanost.
Volební období 2016 – 2020:
Finanční výbor
uvolněný předseda Jan Látka (ČSSD)
Kontrolní výbor
uvolněný předseda Ing. Václav Štekl (KSČM)
Výbor pro podporu cestovního ruchu, sportu a mládeže
předseda Bc. Jiří Struček (ČSSD)
Výbor pro regionální rozvoj a fondy EU
předsedkyně Mgr. Světlana Budková (ČSSD)
Výbor pro oblast dopravy
předseda Mgr. Rudolf Salvetr (ODS)
Výbor pro oblast investic a správu majetku
předseda Mgr. Jan Šašek (ODS)
Výbor pro veřejné zakázky
uvolněný předseda Mgr. Bohuslav Ebermann (Starostové a Patrioti s podporou ...)
Výbor pro výchovu, vzdělávání a zaměstnanost
uvolněný předseda Mgr. Jaroslav Šobr (ČSSD)
Výbor pro zdravotnictví a sociální věci
uvolněný předseda Petr Vanka (ANO 2011)